MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012036	GTCT	2	8	289	296	0 %	50 %	25 %	25 %	222530713
2	NC_012036	TTC	2	6	323	328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530713
3	NC_012036	GGT	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530714
4	NC_012036	T	6	6	458	463	0 %	100 %	0 %	0 %	222530714
5	NC_012036	TTG	2	6	539	544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530714
6	NC_012036	AGC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530714
7	NC_012036	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
8	NC_012036	CAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530715
9	NC_012036	T	6	6	693	698	0 %	100 %	0 %	0 %	222530715
10	NC_012036	TCT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
11	NC_012036	T	6	6	1238	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	222530716
12	NC_012036	A	6	6	1244	1249	100 %	0 %	0 %	0 %	222530716
13	NC_012036	TTTTTG	2	12	1255	1266	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222530716
14	NC_012036	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
15	NC_012036	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
16	NC_012036	TA	3	6	1429	1434	50 %	50 %	0 %	0 %	222530716
17	NC_012036	TG	3	6	1450	1455	0 %	50 %	50 %	0 %	222530716
18	NC_012036	CTT	2	6	1485	1490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
19	NC_012036	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
20	NC_012036	CCTT	2	8	1532	1539	0 %	50 %	0 %	50 %	222530716
21	NC_012036	TGT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530716
22	NC_012036	CT	3	6	3153	3158	0 %	50 %	0 %	50 %	222530717
23	NC_012036	TGC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
24	NC_012036	CAA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
25	NC_012036	TTG	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530717
26	NC_012036	TTTTC	2	10	3384	3393	0 %	80 %	0 %	20 %	222530717
27	NC_012036	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
28	NC_012036	TAC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
29	NC_012036	GTC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
30	NC_012036	TAT	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530717
31	NC_012036	TCT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
32	NC_012036	T	6	6	3549	3554	0 %	100 %	0 %	0 %	222530717
33	NC_012036	CTTT	2	8	3610	3617	0 %	75 %	0 %	25 %	222530717
34	NC_012036	TCT	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
35	NC_012036	CTT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
36	NC_012036	TGC	2	6	3876	3881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
37	NC_012036	AAC	2	6	3882	3887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
38	NC_012036	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
39	NC_012036	ATTT	2	8	3956	3963	25 %	75 %	0 %	0 %	222530717
40	NC_012036	T	6	6	4031	4036	0 %	100 %	0 %	0 %	222530717
41	NC_012036	CTG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
42	NC_012036	TCA	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
43	NC_012036	ACC	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530718
44	NC_012036	TCA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
45	NC_012036	AAG	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
46	NC_012036	GCTT	2	8	4353	4360	0 %	50 %	25 %	25 %	222530718
47	NC_012036	AGA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
48	NC_012036	A	6	6	4644	4649	100 %	0 %	0 %	0 %	222530718
49	NC_012036	T	6	6	4658	4663	0 %	100 %	0 %	0 %	222530718
50	NC_012036	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530719
51	NC_012036	T	8	8	5411	5418	0 %	100 %	0 %	0 %	222530719
52	NC_012036	T	9	9	5484	5492	0 %	100 %	0 %	0 %	222530719
53	NC_012036	CTTCCT	2	12	6150	6161	0 %	50 %	0 %	50 %	222530720
54	NC_012036	TAC	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
55	NC_012036	CTT	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
56	NC_012036	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
57	NC_012036	TCAC	2	8	6401	6408	25 %	25 %	0 %	50 %	222530720
58	NC_012036	T	6	6	6558	6563	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
59	NC_012036	ATCC	2	8	6609	6616	25 %	25 %	0 %	50 %	222530720
60	NC_012036	CCAG	2	8	6617	6624	25 %	0 %	25 %	50 %	222530720
61	NC_012036	CTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
62	NC_012036	ACCC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	0 %	75 %	222530720
63	NC_012036	CTTT	2	8	6734	6741	0 %	75 %	0 %	25 %	222530720
64	NC_012036	TTC	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
65	NC_012036	TTC	2	6	6861	6866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
66	NC_012036	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
67	NC_012036	TG	3	6	6952	6957	0 %	50 %	50 %	0 %	222530720
68	NC_012036	CTA	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
69	NC_012036	ACT	2	6	7103	7108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
70	NC_012036	TGC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
71	NC_012036	TCT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
72	NC_012036	CTGC	2	8	7276	7283	0 %	25 %	25 %	50 %	222530720
73	NC_012036	CTG	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
74	NC_012036	CTGC	2	8	7355	7362	0 %	25 %	25 %	50 %	222530720
75	NC_012036	AGC	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
76	NC_012036	GTTT	2	8	7466	7473	0 %	75 %	25 %	0 %	222530720
77	NC_012036	CAA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530720
78	NC_012036	T	6	6	7601	7606	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
79	NC_012036	TCA	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
80	NC_012036	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
81	NC_012036	ACC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
82	NC_012036	ACC	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
83	NC_012036	TTA	2	6	7766	7771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530720
84	NC_012036	TTC	2	6	7837	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
85	NC_012036	TGGA	2	8	7852	7859	25 %	25 %	50 %	0 %	222530720
86	NC_012036	CTG	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
87	NC_012036	T	6	6	7914	7919	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
88	NC_012036	TC	3	6	7943	7948	0 %	50 %	0 %	50 %	222530720
89	NC_012036	CAG	2	6	7978	7983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
90	NC_012036	GCCC	2	8	8003	8010	0 %	0 %	25 %	75 %	222530720
91	NC_012036	TGC	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
92	NC_012036	GGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530720
93	NC_012036	CCA	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
94	NC_012036	CAG	2	6	8090	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
95	NC_012036	T	6	6	8097	8102	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720
96	NC_012036	TCG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
97	NC_012036	T	6	6	8274	8279	0 %	100 %	0 %	0 %	222530720

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.